Omvendt CNC-fræsning er, at når fræseren skærer ind i emnet, er skærehastighedsretningen modsat arbejdsemnets fremføringsretning.
Under omvendt CNC-fræsning øges skæretykkelsen af skæretænderne gradvist fra nul. I begyndelsen af skæringen, på grund af påvirkningen af skærkantens stumpe radius, glider skæretænderne på arbejdsemnets overflade, hvilket resulterer i ekstrudering og friktion, hvilket resulterer i alvorligt koldt og hårdt lag på denne overflade. Ved glidning i et vist omfang kan skæretænderne skære et metallag af. Når den næste skæretand skærer ind, klemmer den og glider på det kolde hårde lag, hvilket gør skæretanden let at slide og øger emnets overfladeruhed. Derudover, når kontaktvinklen er større end en vis værdi under omvendt fræsning, er den lodrette fræsekomponent let at forårsage vibrationer opad
Fremadgående CNC fræsning er, at skærehastighedsretningen, når fræseren skærer emnet ud, er den samme som emnets fremføringsretning.
Under fremadgående CNC-fræsning falder skæretykkelsen af skæretænderne gradvist fra maksimum til nul, hvilket undgår ekstrudering og glidning af skæretænderne under omvendt fræsning. Arbejdshærdningsgraden af den bearbejdede overflade er stærkt reduceret, overfladekvaliteten er også høj, og værktøjets holdbarhed er også højere end under omvendt fræsning. Samtidig presses skærekraften i lodret retning altid mod arbejdsbordet for at undgå vibration af emnet.
Under fremadgående CNC-fræsning er den langsgående komponentretning af fræsekraften altid den samme som den langsgående kraftretning, der driver arbejdsbordet til at bevæge sig. Hvis der er et mellemrum mellem blyskruen og møtriktransmissionsparret, når den langsgående fræsekomponent er større end friktionen mellem arbejdsbordet og styreskinnen, vil blyskruen, der drives af arbejdsbordet, bevæge sig, hvilket resulterer i vibrationer af arbejdsbordet og den ujævne fremføring af arbejdsbordet. I alvorlige tilfælde vil fænomenet skæring opstå. Derfor bør omvendt CNC-fræsning anvendes på fræsemaskinen uden anordning til eliminering af blyskruemøtrik.